Satoru Fujinima'nın Uyanış adını verdiği gücü onu on sekiz yıl geçmişe, ortaokul günlerini yeniden yaşamaya ve sınıf arkadaşı Kayo Hinazuki'nin ölümüne engel olmaya gönderdi. Ancak gelecekte yaşanacakları bilmesine rağmen Satoru, Kayo'nun bir kez daha ölmesini engelleyemedi. Günümüze geri döndüğünde, kendini annesinin katilini bulmaya hiç olmadığı kadar uzak bir noktada, polisten kaçarken bulan yirmi dokuz yaşındaki Satoru, hem geçmişteki hem günümüzdeki arkadaşlarının hayatı tehlikede olduğu için 1998'e bir kez daha sıçramaya karar veriyor. Satoru, Kayo'yu kurtarmak ve hem onun hem de annesinin katilini adalete teslim etmek için tüm zorluklara göğüs germeye kararlı!