Müfettiş Mehmet bir gecede tüm ahalisi ortadan kaybolan sahil kasabasının gizini çözmekle görevlendirilmiştir. Araştırmaları sonucunda hem amirinin hem de kendisinin yıllardır izini sürdüğü bir isme ulaşacaktır. Olağan şüpheli Recep İrfan Karakaya'nın ikinci doğumu ise İstanbullu bir ailenin Türkiye'nin yakın geçmişindeki üç döneme yayılan talihsiz hikayesinin tatsız bir parçasıdır.

Renkli Taşların Siyah Gölgesi öfke ile başa çıkma yetisinin bir bireyin kaderini nasıl değiştirebileceğini, öfke etrafımızı sardığında ne kadar kırılgan olduğumuzu, öfkeli günleri nasıl "kötü günler" olarak adlandırdığımızı ölüm, aşk ve doğum döngüsü üzerinde anlatıyor.