O tarihin gördüğü en etkileyici ve ilgi çekici kadınlardan biriydi. Hem nefes kesecek kadar güzel hem de adını matematikçi filozof ve astronom olarak tarihe yazdıracak kadar zeki biri ve ne trajiktir ki ölümüyle bile unutulmayacak bir kadındı. Üzerine çullanan onlarca erkeğin darbeleriyle son nefesini veren cesedi sokaklarda sürüklenip eti kemiklerinden ayrılan ama ne olursa olsun tarihin unutulmazları arasına giren bir kadın...

IV. yüzyılda Mısır'ın Roma İmparatorluğu egemenliği altındaki günlerinde İskenderiye sokaklarındaki şiddetli din isyanları şehrin efsanevi kütüphanesine kadar ulaşır. Duvarların ardında hapsolan yetenekli astronom Hypatia öğrencilerinin de yardımıyla ilmini korumak için savaşır.

Bu sırada iki erkek de aralarında Hypatia'nın kalbini kazanmak için yarışır: Orestes ve genç köle Davus.

Marta Sofia'nın filme çekilmiş ve başrolünü Rachel Weisz'in oynamış olduğu "Agora"da tarihin ilk matematikçisi olan İskenderiyeli Hypatia'nın heyecan verici ve trajik hayatı konu ediliyor.