Milli Mücadele yıllarında Sebilürreşad kadrosu Balıkesir'den başlayarak Milli Mücadele'ye destek verir. Mecmuanın başmuharriri Mehmed Akif sahibi ve yazarı Eşref Edip ilk olarak Balıkesir'e giderler. Burada Akif'in Zağnos Paşa Camii'nde Milli Mücadele'yi destekleyen konuşması Eşref Edib tarafından not edilerek Sebilürreşad'da derc edilir ve halka dağıtılır. İstanbul'a dönüşte ise Sebilürreşad'ın idarehanesi Milli Mücadele'nin irtibar bürosu haline getirilir.

İstanbul'da İtilaf Devletleri'nin zulüm ve tazyiklerine aldırmadan Milli İstiklal davasını müdafaa eden Mehmed Akif ve Eşref Edib'in öncülüğündeki Sebilürreşad kadrosu Sebilürreşad'ı gizli gizli bastırarak Anadolu'ya sevk eder.